九天幻境的繁衍不是通过母体，而是从“还真灵珠”中化形而出，没有幼年期。上代神王的女儿清河与女娲生来与众不同，被视为残缺，得当代神王恒无涯一家维护。女娲拜师汲尤，清河则入修炼名门灵心叶山，屡犯杀戒被囚禁。与此同时神王之子恒宝戬发现魔域踪迹，清河杀的那些人被证实是魔种，然后魔族入侵，其背后还有窥视九天多年的云尔泽丝。数次大战后终保住九天幻境，宝戬与清河立下大功。最后发现清河与女娲身上的灵力来自于九天至宝浩天正气，两人自愿还灵，宝戬不愿见她们身死，祭炼了昆仑居带着她们飞出九天幻境，同行的还有盘古等十名神王弟子及其它五人。灵心叶山穹薇天君赠送了宝物“息壤”。
下部“九州岁月”将讲到他们用息壤建造九州，女娲和盘古为众生散灵陨落。宝戬为引开云尔泽丝集聚来的联军，飞入宇宙，留清河在九州苦苦支撑，涉及部分封神演义和其它中国神话。清河终于等到宝戬回来，两人遨游天际。
剧情简介
近百万年前，神王蓝云子带领九天人将入侵九天的魔族打败，然后与妻子思无邪化为灵树日夜散发灵气。故事由他们的后代女娲和清河化形临世开始，女娲是蟒形，虽然修炼困难还是被人们接受，清河如凡人婴儿，因九天人没有幼年期，被视为残缺，受人歧视。两人被当代神王恒无涯收为义女，养在神都的万幻神宫中。神王亲传弟子：雷公、风娘、电母、雨师、夏火、春娇、秋凉、冬寒、冥言十人守护她们的灵珠近百万年，对她们很好。
神王之子宝戬更视她们为责任。盘古等人为女娲找了师父汲尤，宝戬陪伴清河四处寻师，在云市沐花节时得到宝物天命轮盘和绝世青莲，得以长为凡人六、七岁时的模样，美貌绝伦。天命轮盘的拥有者姬卜为之倾倒，尾随他们到了桃夭山。清河在这里得到了座骑如意马，并结识神都大族狐家的女儿狐山魅，一见之下学会了狐家的绝学风雷诀。回到神都后，清河在道幻殿中自学法术，杀了心存不良的金鼎三恶，受伤后变为正常人的大小，美貌更胜以往，被称为“九天第一美人”。宝戬身受重伤闭关疗伤，自觉无法护她周全，让她拜入修炼名门灵心叶山，拜山时走通问道云梯，让穹薇天君有所感悟碧空神功大成，遂得重视，被封清弥圣女。因对魔气有感应，一招杀了望幽谷的婴茶明君，被罚在祈墨山挖石，后发现炼器宝物水晶石。因性格及容貌得灵心叶山上下喜欢。宝戬出关，至风南山探望女娲，并约众人至灵心叶山参与长灵法会。在清河央求下，穹薇允她入长灵法会的御法大阵，在阵中立功，但出阵后再次因为魔气感应杀了十四个人，宝戬为救她受了十四招。清河不欲逃跑，回灵心叶山自首。因说不出杀人理由，虽有许多人说情，还是被公决囚禁在极天渊的冰清泉，永世受冰寒之苦。
女娲及盘古等人陪伴在侧。宝戬不相信清河会无故杀人，决意追查此事。却发现了连接魔域与九天的通幽之地，由此判断出魔族有可能再次入侵，而清河杀的人极可能是魔族内奸。等他从通幽之地破阵而出，已经过了九十二年，示警神王后他赶往极天渊，救出清河。出极天渊时遭遇魔族第三王和第四王伏击，清河表现出非同一般的战力，除第四王燕思南外全歼魔族，所有人受到惊吓，下意识感到恐惧，清河负气独自离开，宝戬无奈带众人回神都协助神王。魔族开启“摩合炽天”，所用的屠神叉和黑袍几乎无视五行法术，又限制了九天人的瞬闪之术、灵心术、驭空术、隐身术，九天危急。幸好穹薇用问道云梯连通了灵心叶山与神都，两地互为援助，保住九天最后的净土。
守城之战中狐山魅的哥哥狐山映表现突出，得神王看重。宝戬的回归给神都带来生机，他发现了摩合炽天的存在，苦苦思索破除的办法。与此同时清河一个人收复了幻界，救了当地管理真君木镇江和他的女儿木徊影，得到他们真实的感激。宝戬的哥哥宝琅带人接管幻界，清河得穹薇指点解开心结，正准备回神都，云市管理真君之子岑灵宝及其表兄赵湘离求她救云市，便赶往云市杀尽魔族救了十八万人。煞星之名在魔族中流传，九天民众视她为希望。在狐山映的建议下，神王决定连通神都、灵心叶山、云市、幻界四地。灵心叶山反攻成功，捉住女统领燕九飞，狐山映施展离间计，宝戬后来又添了一把火，让魔族第一王燕思归对第二王燕思东产生怀疑，最终导致了魔族内乱，暂缓进攻神都。清河突然再次晕迷，宝戬赶往云市救出她。互表情愫后宝戬继续去查摩合炽天，清河则以非凡神力镇守神都。燕思归从燕思东身上发现了盟友“云尔泽丝”意图不善，不想成为傀儡的他思量再三决定与九天合作，先胜云尔泽丝再灭九天。他的信心来自两方面：自身通过摩合炽天获得的强大力量；清河女娲曾被魔气侵袭，可以用天魔之祭唤醒她们的魔性。他用这一点威胁清河与宝戬。清河彷徨，宝戬不受威胁。他在破除摩合炽天时飞升几百万里亲眼看到了云尔泽丝的战队，为日月防线所阻进不了九天。原来他们早在两百万年前就来了，魔族只是他们制造出来专门对付九天的工具。神王集聚九天几乎所有战力，穹薇借出八大飞行法宝，远赴天外对抗云尔泽丝。最终惨胜，却在魔族反攻时得知清河女娲身具魔气，为证清白蓝家后人说出蓝云子用九天至宝浩天正气治疗还真灵珠。围绕着她们有没有罪，九天分裂在即，姐妹俩决定还灵于九天幻境。清河与宝戬举行盛大但没有喜气的婚礼。预计九天后灵气散尽，宝戬不愿见她们身死，在第七天时祭炼了昆仑居带着她们飞出天际，同行的还有盘古等十名神王弟子及其它五人。穹薇天君赠送了可以形成天地的宝物“息壤”。